女性和男性除生殖系统在解剖和生理上有区别外，在形态、身体结构和其他器官系统的生理功能及内分泌系统方面也有差别。同时，女性在月经、妊娠、分娩、哺乳和绝经等过程中的特殊生理变化均会影响妇女的作业能力，并使职业性有害因素对健康的影响存在着性别差异。除矽尘引起的矽肺、局部振动引起的局部振动病等对男女的影响基本相同外，可分为以下两类。
一、对妇女某些生理功能的影响
由于男女在解剖生理功能有差别，诸如男性肌肉较女性约重10％，女性皮下脂肪较男性多14％，女性肌力约相当于男性的％，女性的生理性膝外翻，而导致下肢的负荷能力降低：因此，在考虑妇女体力负荷和作业性质时，应与男子有所区别。此外，妇女的造血系统和肝脏对毒物较为敏感；因此，在妇女接触铅、苯、四氯化碳等毒物时，应予以特别注意。妇女皮肤较柔嫩，易遭受刺激物质诸如铬酸盐、碱性盐类的作用；女性皮肤嫩、皮下脂肪多，接触有机溶剂易经皮肤吸收。女性对农药、除草剂和化肥较男性吸收快，储留时间也长，而这类毒物大多与神经毒性有关。
二、对妇女生殖功能的影响
对妇女的生殖功能(月经、妊娠、哺乳、绝经)有不良影响的因素，不仅对妇女本身有害，而且可累及下一代。通常母亲受到职业性有害因素影响时，对于代的毒效应较父亲为严重，因为除卵子和精子受到损伤外，受精卵、胚胎和胎儿均在母亲子宫内受到影响。职业性有害因素对妇女生殖的作用类型有：(1)影响生殖细胞的形成，可造成初级卵母细胞死亡；(2)影响性机能与受精，铅、汞、锰、镉、有机溶剂或一氧化碳慢性接触，可致性欲减低和性功能紊乱。卵子或精子损伤均会减少受精机会；(3)影响着床，毒物可通过影响激素而引起子宫内膜的异常改变，结果导致自然流产、胚胎重吸收、染色体畸变、生育力低下、死产和出生低体重等：(4)影响胚胎的正常发育，毒物对胎儿的作用可归纳为死胎、发育迟缓或低下、结构畸形和功能缺陷；(5)对围产期和产后的影响，毒物可引起胎儿发育阻滞、影响婴儿存活率和母亲哺乳功能。