最为常见的为呼吸道疾病。呼吸道对冷空气刺激最为敏感，骤然降温使呼吸器官抵抗力下降，病邪乘虚而入。轻则引起外感咳嗽，重则可使气管炎或支气管哮喘及哮喘性支气管炎发作。另外，有胃病史的人也常常在此时病情发作，引发胃穿孔或胃出血。至于风湿病、关节炎患者，更易受气候变化影响。需要特别提醒的，还是心脑血管病人，突然降温往往会诱发中风。秋末冬初时节，脑血栓、脑溢血发病率远高于其他季节。
急性胃肠炎
入秋后，人体的消化功能逐渐下降，肠道抗病能力也相对减弱。如继续生食大量瓜类水果，或直接食用从冰箱里取出的饮料和食物，就可能发生腹泻、痢疾等急慢性胃肠道疾病。容易上火的食物尽量少吃，饮食结构要以清淡为主；在吃海鲜和烧烤时，一定要注意新鲜度。烹饪时一定要加入生姜、料酒以祛寒解毒；秋天应慎食瓜类水果，脾胃虚寒者尤应禁忌。
心脑血管病
秋季是从夏季到冬季的过渡季节，冷暖多变，常常不易立即感知到。秋季的寒暖又常反复，寒而复暖，暖后又寒，使人防不胜防。在晚秋时节，心肌梗死的发病率明显提高，高血压病人在秋冬之交，血压往往要较夏季的血压增高20毫米汞柱，容易造成心脑血管血液循环的障碍。因此，预防秋季感冒受寒对心脑血管病患者而言相当重要。
习惯性便秘
秋季气候干燥，大便随之也会干结难排，表现为便次减少，粪质坚硬，病人常伴有左下腹腹胀感、欲便不畅等。按摩是简便易行的促排便方法，这种方法可在晚上睡前或清晨起床前进行。具体操作方法是：身体仰卧，先将两手掌心摩擦至热。然后两手掌心在右腹下部顺时针方向围绕腹部旋转，共按摩30圈。这个方向正好与粪便在大肠中的运行方向一致，有助于大便的运行。也可以早晚适当喝些蜂蜜水，有助于润肠通便。