农药残留（Pesticide residues），是农药使用后一个时期内没有被分解而残留于生物体、收获物、土壤、水体、大气中的微量农药原体、有毒代谢物、降解物和杂质的总称。
农药残留原因
（1）农药性质与农药残留
现已被禁用的有机砷、汞等农药，由于其代谢产物砷、汞最终无法降解而残存于环境和植物体中。
六六六，滴滴涕等有机氯农药和它们的代谢产物化学性质稳定，在农作物及环境中消解缓慢，同时容易在人和动物体脂肪中积累。因而虽然有机氯农药及其代谢物毒性并不高，但它们的残毒问题仍然存在。
有机磷、氨基甲酸酯类农药化学性质不稳定，在施用后，容易受外界条件影响而分解。但有机磷和氨基甲酸酯类农药中存在着部分高毒和剧毒品种，如甲胺磷、对硫磷、涕灭威、克百威、水胺硫磷等，如果被施用于生长期较短、连续采收的蔬菜，则很难避免因残留量超标而导致人畜中毒。
另外，一部分农药虽然本身毒性较低，但其生产杂质或代谢物残毒较高，如二硫代氨基甲酸酯类杀菌剂生产过程中产生的杂质及其代谢物乙撑硫脲属致癌物，三氯杀螨醇中的杂质滴滴涕，丁硫克百威、丙硫克百威的主要代谢物克百威和3-羟基克百威等。
农药的内吸性、挥发性、水溶性、吸附性直接影响其在植物、大气、水、土壤等周围环境中的残留。
温度、光照、降雨量、土壤酸碱度及有机质含量、植被情况、微生物等环境因素也在不同程度上影响着农药的降解速度，影响农药残留。
（2）使用方法与农药残留
一般来讲，乳油、悬浮剂等用于直接喷洒的剂型对农作物的污染相对要大一些。而粉剂由于其容易飘散而对环境和施药者的危害更大。
任何一个农药品种都有其适合的防治对象、防治作物，有其合理的施药时间、使用次数、施药量和安全间隔期（最后一次施药距采收的安全间隔时间）。合理施用农药能在有效防治病虫草害的同时，减少不必要的浪费，降低农药对农副产品和环境的污染，而不加节制地滥用农药，必然导致对农产品的污染和对环境的破坏。
农药残留的危害
（1）农药残留对健康的影响
食用含有大量高毒、剧毒农药残留引起的食物会导致人、畜急性中毒事故。长期食用农药残留超标的农副产品，虽然不会导致急性中毒，但可能引起人和动物的慢性中毒，导致疾病的发生，甚至影响到下一代。
（2）农药残留对农业生产的影响
由于不合理使用农药，特别是除草剂，导致药害事故频繁，经常引起大面积减产甚至绝产，严重影响了农业生产。土壤中残留的长残效除草剂是其中的一个重要原因。
农药残留的控制
（1）注意栽培措施
一要选用抗病虫品种；二要合理轮作，减少土壤病虫积累；三要培育壮苗，合理密植，清洁田园，合理灌溉施肥；四要采用种子消毒和土壤消毒，杀灭病菌；五要采用灯诱、味诱等物理方法，诱杀害虫。比如：黄板诱杀蚜虫、粉虱、斑潜蝇等；灯光诱杀斜纹夜蛾等鳞翅目及金龟子等害虫；小菜蛾、斜纹夜蛾、甜菜夜蛾等专用性诱剂诱杀。
（2）采取生物防治方法
充分发挥田间天敌控制害虫进行防治。首先选用适合天敌生存和繁殖的栽培方式，保持天敌生存的环境。比如果园生草栽培法，就可保持一个利于天敌生存的环境，达到保护天敌的目的。其次要注意，农作物一旦发现害虫为害，应尽量避免使用对天敌杀伤力大的化学农药，而应优先选用生物农药。常用生物农药种类有：BT生物杀虫剂和抗生素类杀虫杀菌剂，如浏阳霉素、阿维菌素、甲氧基阿维菌素、农抗120、武夷霉素、井岗霉素、农用链霉素等。昆虫病毒类杀虫剂，如奥绿1号。保幼激素类杀虫剂，如灭幼脲（虫索敌）、抑太保。植物源杀虫剂，如苦参素、绿浪等。
（3）选用低毒、低残留的化学农药
农作物生长后期，在生物农药难以控制时，可用这类农药进行防治。适用的农药主要有多杀菌素（菜喜）、安打、虫酰肼（美满、阿赛卡）、虫螨腈（除尽）、氟虫腈（锐劲特）、伏虫隆（农梦特）、菊酯类、农地乐、除虫净、辛硫磷、毒死蜱（新农宝、乐斯本）、吡虫啉（蚜虱净）、扫螨净、安克、杀毒矾、霜腺锰锌（克露、克丹）、霉能灵、腐霉利、敌力脱、扑海因、嘧菌胺（施佳乐）、甲霜灵、可杀得、大生M—45、多菌灵等。严禁使用高毒高残留农药，如3911、呋喃丹、甲基1605、甲胺磷、氧化乐果等。农药在使用中要注意，选用对口农药，适时使用农药。严格控制浓度和使用次数，采用合理的用药方法。注意不同种类农药轮换使用，防止病虫产生抗药性。严格执行农药使用安全间隔期。